Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc1P35601 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms