Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms