Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc5P32043 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms