Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VtnP29788 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VtnP29788 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VtnP29788 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VtnP29788 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VtnP29788 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
VtnP29788 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VtnP29788 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VtnP29788 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms