Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp3P28862 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms