Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxraP28700 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxraP28700 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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