Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms