Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apex1P28352 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apex1P28352 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apex1P28352 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apex1P28352 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apex1P28352 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms