Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Etv4P28322 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Etv4P28322 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Etv4P28322 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Etv4P28322 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Etv4P28322 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Etv4P28322 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Etv4P28322 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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