Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav1P27870 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms