Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms