Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl3P27659 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms