Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U2af2P26369 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms