Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CftrP26361 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CftrP26361 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CftrP26361 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CftrP26361 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CftrP26361 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CftrP26361 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CftrP26361 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CftrP26361 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CftrP26361 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CftrP26361 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CftrP26361 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CftrP26361 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CftrP26361 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CftrP26361 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CftrP26361 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CftrP26361 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CftrP26361 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CftrP26361 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms