Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr3aP23979 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr3aP23979 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htr3aP23979 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Htr3aP23979 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Htr3aP23979 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htr3aP23979 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htr3aP23979 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htr3aP23979 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htr3aP23979 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htr3aP23979 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms