Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms