Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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