Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RarbP22605 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RarbP22605 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RarbP22605 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RarbP22605 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RarbP22605 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RarbP22605 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms