Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms