Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms