Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SagP20443 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SagP20443 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SagP20443 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SagP20443 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SagP20443 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SagP20443 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms