Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TP20293 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TP20293 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TP20293 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms