Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NelfeP19426 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NelfeP19426 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NelfeP19426 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfeP19426 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfeP19426 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NelfeP19426 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfeP19426 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NelfeP19426 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NelfeP19426 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NelfeP19426 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NelfeP19426 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms