Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NefhP19246 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NefhP19246 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms