Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms