Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RargP18911 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RargP18911 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RargP18911 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RargP18911 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RargP18911 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RargP18911 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RargP18911 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RargP18911 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RargP18911 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RargP18911 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RargP18911 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms