Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18532 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18532 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18532 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18532 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18532 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18532 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18532 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18532 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18532 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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