Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18530 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P18530 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
P18530 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P18530 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
P18530 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P18530 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P18530 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18530 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18530 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18530 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms