Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18525 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18525 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18525 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms