Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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