Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnaP17918 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms