Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms