Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrphP15331 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrphP15331 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrphP15331 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms