Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd1P13516 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms