Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms