Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms