Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DmdP11531 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DmdP11531 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DmdP11531 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DmdP11531 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DmdP11531 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DmdP11531 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DmdP11531 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DmdP11531 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DmdP11531 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DmdP11531 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DmdP11531 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms