Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms