Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Schip1P0DPB4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms