Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3cP0DOY1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms