Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Becn2P0DM65 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms