Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms