Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefmP08553 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefmP08553 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefmP08553 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NefmP08553 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NefmP08553 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefmP08553 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefmP08553 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefmP08553 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms