Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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H2-Eb1P04230 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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H2-Eb1P04230 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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H2-Eb1P04230 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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H2-Eb1P04230 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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H2-Eb1P04230 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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