Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tk1P04184 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms