Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamc1P02468 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc1P02468 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms