Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01878 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01878 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms