Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01811 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01811 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01811 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01811 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms