Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp1O89090 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sp1O89090 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms