Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopeO89079 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopeO89079 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CopeO89079 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CopeO89079 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CopeO89079 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms